Papa João VIII (872-882) manda erguer uma cinta de fortificação ao redor da Basílica e de sua abadia, para protegê-las de eventuais ataques: esse conjunto é nomeado “Joanópolis”.

Papa Gregório Magno (1073-1085), abade do mosteiro antes de ser eleito Papa, manda suspender o piso do transepto, ligando-o à nave, faz erigir um campanário (destruído no século XIX), ao mesmo tempo em que a entrada principal da Basílica é dotada de uma esplêndida porta bizantina^[1], composta de 54 painéis gravados em tauxia de prata.

1) A porta bizantina foi encomendada a Constantinopla em 1070 pelo cônsul Pantaleão (para remissão de seus pecados, uma vez que esse mercador se enriqueceu fazendo comércio de escravos muçulmanos e cristãos, tráfico proibido pela Igreja). O artista Teodoro representa um ciclo cristológico, um ciclo apostólico (o martírio dos apóstolos) e um ciclo profético. A porta foi remontada, em nossos dias, na contrafachada da Porta Santa.